基本概念 注意事项 1. #! # !是一个特殊标记,说明这是一个可执行的脚本。除了第一行,其他以#开头的都不再生效,为注释。 #!后面是脚本的解释器程序路径。这个程序可以是shell,程序语言或者其他通用程序,常用的是bash、sh。 2. sh vs […]
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❤❤❤❤❤简介❤❤❤❤❤ CHEMKlN-PRO,相比之前的版本,该软件反应器模块更加丰富、用户界面更加友好、模拟速度更快、而且后处理功能实用方便 数据包的应用 热力学数据 在CHEMKIN中,热力学数据被用来定义反应中涉及到的分子的元素组成、 物相和热力学性质。热力学性质的格式采用NASA标准,由14个参数组成。这 14个参数分为两段,前7个参数用来计算高温区间(一般为1000 K以上)的热 力学参数,如等压热容$Cp$、生成焓$H$0以及熵$S$0。后7个参数用来计算低温区间 (一般为1000 […]
核数 = 最大负载:在多核系统上,您的负载不应超过可用核数。 Core就是Core 的经验法则:CPU Core的性能与CPU上的分布方式无关。两个四核等于四个双核等于八个单核。它们的性能与八个Core的性能等同。 总结 我们来看一下uptime命令的输出: ~ $ […]
课题组自建的zotero webdav服务器已上线,搭配易有云或者wireguard即可使用。自建的zotero wendav服务器有以下优势: 使用方法:登录个人的zotero账号后,在菜单栏通过Edit>Preference>sync,进行以下配置后保存更改即可192.168.33.3:8080/webdav/zotero/lym 192.168.168.3:8080/webdav/zotero/lym (wireguard)注意将以上同步地址替换为个人文件夹 (替换个人用户名即可, 废弃,使用上法):
Roy Kid 中国科学技术大学 物理化学硕士在读 在做高分子体系中添加大直径填料的时候遇到了一个问题:相同的体系,加入填料后的模拟速度是不加入的五分之一。查看output的时候发现,neigh一项占去了总时间的一半以上。这就很诡异,因为正常情况应该是Pair占到七成左右比较合理。 想要解决问题,就需要从lammps计算原子对之间的势的算法说起。 首先,我要计算一个原子受到那些原子的作用,首先得去寻找周围的原子。这样,为了避免每个timestep都要去搜索,lammps先拉一个叫neighbor list 的表,这个表里储存了所有周遭原子的信息。这个表的范围是多大呢,(cutoff + […]
姚太多啊 5,413 人赞同了该文章 我这个傻子的matplotlib学习过程很神奇: 刚开始,找几个教程,呕吼,简单,plt.*** 一顿写。画完了。遇到坐标啊之类的细节不会调? 打开谷哥,要啥搜啥。 我最开始觉得这样蛮好的,这是一个很容易学的lib嘛。 然后问题出现了,matplotlib最烦人的地方就是,同样一个目标,你可以有N种不同的方法去实现他。比如说哦,加标题: plt.set_title() […]
对于Gaussian使用过程中遇到的报错信息,可以通过访问以下几个网页进行查询并解决相应的问题: Gaussian 常见报错及解决方法;新手求助报错时的注意事项http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=4829&fromuid=41247(出处: 计算化学公社) 解决SCF不收敛问题的方法 http://sobereva.com/61