使用Apptainer创建基于Jupyter的数据分析及可视化平台 本教程将带您一步步学习如何利用Apptainer (Singularity)容器和Miniconda3,构建一个便于跨环境部署和分享的数据分析与可视化包。我们将重点介绍容器的设置,以及在容器中运行Jupyter Lab实例的方法。通过本教程,您将快速掌握如何搭建数据分析和可视化环境。 1. 准备工作 在开始之前，请确保您已经了解了singularity的基本使用方法 2. 编写Singularity文件 首先，我们需要创建一个Singularity文件来定义我们的容器。在本例中，我们将使用一个基于Miniconda3的Singularity文件。这个文件将定义容器的环境以及如何运行其中的应用程序。请将以下内容保存为miniconda_mda.def文件。 […]
Monthly Archives: March 2024
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1. VaReCoF简介 该程序实现了可变反应坐标过渡态理论（VRCTST）和任意无势垒反应的刚体轨迹模拟。VaReCoF可通过与 MOLPRO 和 GAUSSIAN 电子结构代码的接口直接进行从头算评估,计算得到热高压复合速率常数和微正则E/J分辨的反应通量。 VaReCoF程序的显著特点: ①每个片段的任意枢轴点数量 ②对枢点位置和距离进行方便的采样 […]