本文档详细介绍如何使用 Singularity 容器编译和安装 VASP 6.3.2。内容涵盖从环境准备、依赖安装到 VASP 编译的每一个步骤。 前提条件： 需要一个支持 Singularity […]
Monthly Archives: May 2024
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一、CATMAP简介 CATMAP是一款求解催化微动力学的软件包，旨在标准化和自动化将“描述符空间”转换为多相催化反应速率的过程。它使用基于描述符的分析方法，通过关注少量关键描述符来减少理解催化反应的复杂性，从而简化与反应动力学相关的高维参数空间。这种方法不仅减少了计算工作量，还增强了对催化趋势的理解。 二、编译及安装 本安装是基于Singularity镜像完成，故整个安装包括准备编写Singularity文件、创建容器、运行容器等过程，使得在启动容器后直接使用 Jupyter Lab 进行数据分析和可视化工作。具体流程如下： 1、创建Singularity文件 # Use […]
0. 说明 为方便大家在方便地进行DFT-D3和DFT-D4色散校正计算，我们将Grimme等人开发的dftd3、dftd4校正程序进行了apptainer容器打包。使用容器可以避免在不同计算环境下编译安装的麻烦，实现即取即用，提高计算效率。具体使用方法如下： 1. 示例使用命令 1.1 DFT-D3 ~$ apptainer exec […]