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如何在LAMMPS运算中断后继续计算 使用restart文件继续计算 预防性设置 在运行模拟之前，建议在input文件中设置断点保存： restart 1000 restart_file.1 restart_file.2 这种设置的优点： 每1000步会轮流写入两个文件 […]
考虑到MESS软件依赖、conda环境变量的复杂性以及个人使用需求的差异性，现分享两种MESS软件的安装和使用方法以供选择。 1. 公共目录下的Singularity容器化安装及使用 考虑到用户需求的差异，我们提供了两个MESS版本（MESS1.1.0和MESS2.9.0）以便使用。下面将以MESS1.1.0版本为例，具体介绍容器化过程和使用方法。 1.1 创建Singularity容器文件 # 指定容器基础镜像为Docker镜像，从continuumio/miniconda3:24.3.0-0镜像开始构建 Bootstrap: docker […]
本文档详细介绍如何使用 Singularity 容器编译和安装 VASP 6.3.2。内容涵盖从环境准备、依赖安装到 VASP 编译的每一个步骤。 前提条件： 需要一个支持 Singularity […]
一、CATMAP简介 CATMAP是一款求解催化微动力学的软件包，旨在标准化和自动化将“描述符空间”转换为多相催化反应速率的过程。它使用基于描述符的分析方法，通过关注少量关键描述符来减少理解催化反应的复杂性，从而简化与反应动力学相关的高维参数空间。这种方法不仅减少了计算工作量，还增强了对催化趋势的理解。 二、编译及安装 本安装是基于Singularity镜像完成，故整个安装包括准备编写Singularity文件、创建容器、运行容器等过程，使得在启动容器后直接使用 Jupyter Lab 进行数据分析和可视化工作。具体流程如下： 1、创建Singularity文件 # Use […]
0. 说明 为方便大家在方便地进行DFT-D3和DFT-D4色散校正计算，我们将Grimme等人开发的dftd3、dftd4校正程序进行了apptainer容器打包。使用容器可以避免在不同计算环境下编译安装的麻烦，实现即取即用，提高计算效率。具体使用方法如下： 1. 示例使用命令 1.1 DFT-D3 ~$ apptainer exec […]
为方便大家出差报销，减少报销环节给老师和财务处带来的额外工作，特整理此帖。大家在出差前后可参考此帖准备报销时所需的各类凭证，也希望大家共同把这个攻略完善得更加详尽周到。 依据本贴准备报销凭证前，请确保已详细阅读了校财务处的相关要求！ 校财务信息: http://cw.dlut.edu.cn/ 1. 各类报销凭证准备 1.1 机票报销凭证 登机牌：登机后切记妥善保存 电子发票：在各购票平台开票时时切记包含行程信息、航班号、乘机人信息 […]
注：缓存磁盘使用情况查看程序下载：Nabula Node Disk Usage Collecter 注：集群健康监测任务执行指南：集群健康监测任务执行指南.docx 注：上传集群文件示例： 轮值集群健康监察员排班表 注：轮值工作周五周六进行即可 请大家以蒙蒙师姐为标准准备附件 […]